У людському організмі знайдено сверхраспространённий вірус, про який ми не знали до сьогоднішнього дня

Вчені тільки що заявили про відкриття нового, неймовірно поширеного вірусу, який живе всередині людських кишкових бактерій. Він отримав назву "crAssphage" і майже в шість разів більше поширений, ніж всі інші бактеріальні віруси разом узяті. Але як ми зуміли не помічати його стільки часу?

Причина того, що ми не знайшли crAssphage раніше, полягає в тому, що ми і не знали, що його треба шукати. Ось що це означає.

Хоча нові технології секвенування стають все більш швидкими і дешевими, вони як і раніше мають одну слабкість: вони гарні для виявлення речей, про існування яких ми вже знаємо, але вони погано підходять для пошуку нових організмів. Коли дослідники вивчають органічний зразок, вони отримують суп з фрагментів ДНК всіх живих істот, що мають відношення до цього зразка - бактерій, вірусів і самої людини. Потім ці фрагменти необхідно зібрати в послідовності, які ми можемо ідентифікувати. Якщо ми виявляємо ланцюг, специфічну для генома деякої бактерії - значить, ми знайшли цю бактерію в зразку.

Проблема ж полягає в тому, що якщо ми ще не знаємо послідовності невідомого нам вірусу - ми не можемо його знайти за допомогою цієї техніки. А фактично, автор нового дослідження crAssphage Бас Датіл повідомляє, що їм невідомі майже 75 відсотків ДНК-послідовностей у вивчених ними зразках.

Знайти новий вірус команда Датіла змогла, застосувавши зовсім інший підхід, заснований на простій ідеї: фрагменти, які раз по раз зустрічаються в одному і тому ж зразку, з великою часткою ймовірності є частинами одного генома. Вони використовували техніку так званої крос-збірки для ідентифікації однієї такої групи повторюванихпослідовностей в зразках, взятих у 12 людей. Потім вони зібрали ці послідовності в єдиний геном.

І отримали саме це: вірус crAssphage, названий так на честь техніки крос-збірки (cross-assembly), яка привела до його відкриття. Вони встановили, що crAssphage живе всередині Bacteroides - поширеної групи бактерій, що мешкають в нашому кишечнику.

В результаті досліджень, команда виявила crAssphage в 75% кишкових послідовностей людей в США, Європі, і Південної Кореї. Ми поки не знаємо, що саме роблять ці фаги в нашому кишечнику, але вони абсолютно точно грають якусь роль в нашій кишкової мікробної екосистемі.

І наостанок цікавий факт: вчені підрахували, що в нашому тілі приблизно в 100 разів більше вірусних частинок, ніж власне людських клітин. Так що нам належить ще багато роботи, щоб з'ясувати, чим ми є насправді.